クライズ・シティ：G本部
┣クライズ・シティ
┃┣リニアラインホーム
┃┃┗連絡通路突破
┃┗宇宙船ドック
┃　┗暗黒の衛星
┣LL：中継ターミナル
┃┗オロール展望広場
┃　┣プラント奪還
┃　┗敵意の満ちる星
┣HIVE・3号
┃┗中央制御室方面
┃　┗SEEDの胎動
┣ダルガン展望広場
┃┗クライズ・シティ方面
┃　┣黒き星に巣くうモノ
┃　┣真影に至る闇
┃　┗機身に宿る亡霊
┣侵食天体リュクロス
┃┗中核部方面
┃　┗暗黒神の封印
┗ファルス・メモリア
 　┗ナノトランスの渦
 　　┣遥かなる地の記憶
 　　┗封印されし時の船旅

ホルテス・シティ：G本部
┣ホルテス・シティ
┃┣フライヤーベース
┃┃┣原生生物鎮圧
┃┃┗星の傷跡
┃┣リニアトレインホーム
┃┃┗貨物列車救援
┃┗同盟軍本部
┃　┗同盟軍本部奪還
┣ラフォン草原：野営基地
┃┗湖畔公園方面
┃　┣草原の支配者
┃　┗遺跡の奥に眠るモノ
┣ラフォン草原：湖畔公園
┃┣野営基地方面
┃┃┣紅の巨獣
┃┃┗海溝に沈む海神の宮
┃┗海底プラント方面
┃　┗狂う珍獣
┣海底プラント：臨時拠点
┃┣ラフォン草原方面
┃┃┗研究施設奪還
┃┗旧メルヴォア・シティ方面
┃　┗エンドラムの残党
┣デネス湖
┃┗海底プラント方面
┃　┗蒼海の母神
┃┗デネス・レリクス方面
┃　┗双頭の守護獣
┣フォランの滝
┃┣デネス湖方面
┃┃┗旧跡の死闘
┃┗旧ローゼノム・シティ方面
┃　┗双頭の遺跡
┣同盟軍メトロリニアホーム
┃┗中央司令部方面
┃　┗メトロリニア突破
┣同盟軍中央司令部
┃┣パラカバナ海岸方面
┃┃┗電脳の化身
┃┗メトロリニアホーム方面
┃　┗避難経路確保
┣旧ローゼノム・シティ
┃┗パラカバナ海岸方面
┃　┗雷獣の都
┗パラカバナ海岸
  ┣同盟軍中央司令部方面
  ┃┗暴走SEED特急
  ┗旧ローゼノム・シティ方面
 　　┗渚を照らす太陽の獣

オウトク・シティ：G本部
┣オウトク・シティ
┃┣フライヤーベース
┃┃┣ミズラキ保護区防衛
┃┃┗緑林突破
┃┗グラール教団・昇空殿
┃　┗流水の神殿
┣シコン諸島：タンゼ巡礼路
┃┣アガタ諸島方面
┃┃┣虹色の法獣
┃┃┗狂信者の杜
┃┗ハビラオ禁止区：村跡方面
┃　┗胞子の丘陵
┣ミズラキ保護区：クゴ温泉
┃┣クゴ温泉方面
┃┃┗凶飛獣討伐
┃┗アガタ諸島方面
┃　┣月下の翼獣
┃　┗生態系の保護
┣アガタ諸島：聖地エガム
┃┣オウトク・シティ方面
┃┃┣東方より来るモノ
┃┃┣密林の侵入作戦
┃┃┗破戒者たちの宴
┃┗アガタ・レリクス方面
┃　┗聖地奪還
┣ミズラキ保護区：ケゴ広場
┃┗ケゴ広場方面
┃　┣桜華の法撃
┃　┗研究の代価
┣ハビラオ禁止区：村跡
┃┗サグラキ保護区方面
┃　┗踊る珍鳥
┣サグラキ保護区
┃┗オウトク・シティ方面
┃　┗花吹雪く追走戦
┣昇空殿・上層区
┃┗支天閣方面
┃　┗白き聖獣
┗旧ハクラ寺院
  ┣クゴ温泉方面
  ┃┗露霞む遺跡の掃討戦
  ┗オウトク・シティ方面
  　　┗百鬼夜行の城

ダグオラ・シティ：G本部
┣ダグオラ・シティ
┃┗フライヤーベース
┃　┣封印装置防衛
┃　┗修羅の谷
┣西クグ砂漠：野営基地
┃┗ガレニガレ炭鉱方面
┃　┣最凶の砂獣
┃　┗砂丘の楼閣
┣ガレニガレ渓谷：盆地
┃┗地底湖方面
┃　┗鉱山防衛
┣ガレニガレ鉱山：地底湖
┃┣野営基地方面
┃┃┗ローグスの間道
┃┗炭鉱地帯方面
┃　┣坑道の奪還
┃　┣砂塵の機械戦士
┃　┗最果ての実験基地
┣西クグ砂漠：アジス・クグ
┃┗ガレニガレ鉱山方面
┃　┣奪われた破壊兵器
┃　┗武火燃ゆる灼熱の森
┣北方大陸：ヴィオ・トンガ
┃┣グラニグス鉱山方面
┃┃┗氷雪の洞窟
┃┗ガレニガレ鉱山方面
┃　┣銀嶺眠る太古の慟哭
┃　┗坑道駆ける群団
┣イル・カーボ基地
┃┗グラニグス鉱山方面
┃　┗穿つ双剣の遺産
┣北方大陸：グラニグス鉱山
┃┗ボルワイヤル方面
┃　┗蛇獣覚醒
┗カジノ・ボルワイヤル
  ┗グラニグス鉱山方面
  　　┗土煙る廃坑

Clyez City : GUARDIANS Branch
┣Clyez City
┃┣Linear Line Platform 
┃┃┗Unsafe Passage
┃┗Space Dock
┃　┗Dark Satelite
┣Transfer Terminal
┃┗Aurorey Viewing Plaza Area
┃　┣Fight for Food
┃　┗Rising Malice 
┣Hive #3
┃┗HIVE Central Control Room Area
┃　┗SEED Awakened
┣Dailgun View. Plaza
┃┗Clyez City Area
┃　┣The Black Nest
┃　┣True Darkness
┃　┗Mechanical Ghosts
┣Ryucross
┃┗Core Area
┃　┗The Dark God
┗Falz Memoria
 　┗Nanotrance Vortex
 　　┣Distant Memory
 　　┗Fantastic Voyage

Holtes City : GUARDIANS Branch
┣Holtes City
┃┣Flyer Base
┃┃┣Mad Creatures
┃┃┗Scarred Planet
┃┣Linear Line Platform
┃┃┗Train Rescue
┃┗AMF Headqarters
┃　┗AMF HQ Recovery
┣Raffon Field Base
┃┗Lakeshore Park Area
┃　┣Plains Overlord
┃　┗Sleeping Warriors
┣Lakeshore Park
┃┣Field Base Area
┃┃┣Crimson Beast
┃┃┗Sunken Shrine
┃┗Underwater Plant Area
┃　┗The Mad Beasts
┣Seabed Plant Base
┃┣Raffon Meadow Area
┃┃┗Lab Recovery
┃┗Old Mellvore City Area
┃　┗Endrum Remnants
┣Denes Lake
┃┗Underwater Plant Area
┃　┗Aquatic Mama
┃┗Relics Site Area
┃　┗The Dual Sentinel
┣Foran Waterfall
┃┣Lake Denes Area
┃┃┗Duel of the Relics
┃┗Old Rozenom City Area
┃　┗Two-Headed Ruins
┣AMF Metro Platform
┃┗Central Command Area
┃　┗Military Subway
┣AMF Cen. Command
┃┣Paracabana Coast Area
┃┃┗Electronic Brain
┃┗AMF Platform Area
┃　┗Evacuation Route
┣Old Rozenom City
┃┗ Paracabana Coast Area
┃　┗Lightning Beasts
┗Paracabana Coast
  ┣Central Command Area
  ┃┗SEED Express
  ┗Old Rozenom Area
 　　┗Beach Bum Beast

 Ohtoku City : GUARDIANS Branch
┣Ohtoku City
┃┣Flyer Base
┃┃┣Mizuraki Defense
┃┃┗Forested Islands
┃┗COG : Pavilion of Air
┃　┗Sacred Stream
┣Shikon Tanze Route
┃┣Agata Islads Area
┃┃┣Rainbow Beast
┃┃┗Grove of Fanatics
┃┗Habirao F.D. : Old Village Area
┃　┗Hill of Spores
┣Kego Clearing
┃┣Kugo Hot Springs Area
┃┃┗Demons Above
┃┗Agata Islands Area
┃　┣Moonlight Beast
┃　┗Eco Protection
┣Agata Islands : Egam
┃┣Ohtoku City Area
┃┃┣The Eastern Peril
┃┃┣Forest Infiltration
┃┃┗Sinners' Banquet
┃┗Agata Relics Site Area
┃　┗The Holy Ground
┣Kugo Hot Springs
┃┗Kego Clearing Area
┃　┣Sakura Blast
┃　┗Cost of Research
┣Habirao F.D. : Village
┃┗Saguraki C.D. Area
┃　┗Dancing Birds
┣Saguraki C.D.
┃┗ Ohtoku City Area
┃　┗Flowery Pursuit
┣Pavilion of Air : Top
┃┗Shitenkaku Area
┃　┗White Beast
┗Old Hakura Temple
  ┣Kugo Hot Springs Area
  ┃┗Misty Ruins
  ┗Ohtoku City Area
  　　┗Castle of Monsters

 Dagora City : GUARDIANS Branch
┣Dagora City
┃┗Flyer Base
┃　┣System Defense
┃　┗Valley of Carnage
┣W. Kugu : Field Base
┃┗Galenigare Tunnel Area
┃　┣Desert Terror
┃　┗Desert Stronghold
┣Galenigare : Bassin
┃┗Galenigare Tunnel Area
┃　┗Mine Defense
┣Galenigare : Lake
┃┣Field Base Area
┃┃┗Rogues' Shortcut
┃┗Mining Area
┃　┣Tunnel Recapture
┃　┣Desert Goliath
┃　┗Lonely Laboratory
┣W. Kugu : Ajis Kugu
┃┗Galenigare Tunnel Area
┃　┣Stolen Weapon
┃　┗Red Hot Jungle
┣N. Cont. : Vio Tonga
┃┣Granigs Mine Area
┃┃┗Caves of Ice
┃┗Galenigare Tunnel Area
┃　┣Snowcap Screamer
┃　┗Lode Runner
┣Il Cabo Base
┃┗Granigs Mine Area
┃　┗Bladed Legacy
┣N. Cont. : Granigs
┃┗Voloyal Area
┃　┗Awoken Serpent
┗Casino Voloyal
  ┗Granigs Mine Area
  　　┗Dusty Mine